Naime, prema nekim navodima, Kejti Holms i Suri su "izbačene" iz glumčevog života upravo zbog sajentologije. Članovi ove crkve, međutim, tvrde da im nije zabranjeno da "imaju posla" s osobama druge vere.
Glumac je poslednji put viđen u javnosti sa ćerkom u avgustu 2012, kada je ona imala šest godina, i to u jednom od Diznijevih zabavnih parkova na Floridi.
On i Kejti Holms venčali su se 2006. godine, ali je glumica podnela zahtev za razvod u junu 2012. Tada je jedan izvor blizak Kejti rekao da ona nije želela da Suri odrasta u duhu sajentologije i da se školuje kod kuće.
Nemaju svi takve muke: Kim Kardašijan ponovo naljutila majke širom sveta (FOTO)
Tom ima još dvoje dece - Izabelu i Konora, koje je usvojio tokom braka s Nikol Kidman i koji su, kao otac, odani sajentolozi. S njima glumac ima odličan odnos, ali mnogi tvrde da je ih je on otuđio od Nikol.
